Manganez esas olarak tıp alanında dezenfektan, farmasötik oksidan, katalizör vb. olarak kullanılır.
Örneğin potasyum permanganat çok güçlü bir oksidan olduğundan tıpta en sık kullanılan dezenfektanlardan biridir. %0,1+ potasyum permanganat çözeltisi dezenfeksiyon ve sterilizasyonda rol oynayabilir. Manganez, sedatif fenalin üretim sürecinde bir ara oksidan olarak kullanılmasının yanı sıra, antipiretik analjezik fenasetin üretmek için bir katalizör olarak da kullanılır.
Manganez ayrıca tıbbi alanda manganez eksikliğini tedavi etmeye yönelik bazı ilaçlar gibi bazı ilaçları ve ilaç formülasyonlarını hazırlamak için de kullanılabilir. Ayrıca manganez bitki ekstraktı endüstrisinde de katalitik bir rol oynayabilir.
Pek çok eczane firması üretim süreçlerine mangan altı kimyasallarını katıyor: